Jedarčani protein 12 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NOL12 sa hromosoma 22.[5][6]

NOL12
Identifikatori
AliasiNOL12
Vanjski ID-jeviMGI: 2146285 HomoloGene: 32577 GeneCards: NOL12
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 22 (čovjek)
Hrom.Hromosom 22 (čovjek)[1]
Hromosom 22 (čovjek)
Genomska lokacija za NOL12
Genomska lokacija za NOL12
Bend22q13.1Početak37,681,673 bp[1]
Kraj37,693,476 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 15 (miš)
Hrom.Hromosom 15 (miš)[2]
Hromosom 15 (miš)
Genomska lokacija za NOL12
Genomska lokacija za NOL12
Bend15|15 E1Početak78,819,133 bp[2]
Kraj78,827,838 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija rRNA binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
single-stranded DNA binding
Ćelijska komponenta Jedarce
jedro
Biološki proces rRNA processing
GO:0007576 nucleolus organization
positive regulation of cell population proliferation
positive regulation of cell growth
negative regulation of apoptotic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_024313

NM_133800

RefSeq (bjelančevina)

NP_077289

NP_598561

Lokacija (UCSC)Chr 22: 37.68 – 37.69 MbChr 15: 78.82 – 78.83 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 213 aminokiseline, a molekulska težina 24.663 Da.[6]

1020304050
MGRNKKKKRDGDDRRPRLVLSFDEEKRREYLTGFHKRKVERKKAAIEEIK
QRLKEEQRKLREERHQEYLKMLAEREEALEEADELDRLVTAKTESVQYDH
PNHTVTVTTISDLDLSGARLLGLTPPEGGAGDRSEEEASSTEKPTKALPR
KSRDPLLSQRISSLTASLHAHSRKKVKRKHPRRAQDSKKPPRAPRTSKAQ
RRRLTGKARHSGE

Funkcija

uredi

Pokazalo se da se ljudskii NOL12 nalazi u jedarcetuu i reguliše jedarčanu strukturu i homeostazu, održavanjem nivoa multifunkcionalnih fibrilarinskih i nukleolinskih proteina. Njegov nedostatak dovodi do aktivacije p53, što rezultira zaustavljanjem ćelijskog ciklusa u njgovoj fazi G2. Nol12 ili hNol12 pokreću p53 indukovano starenje ćelija sugerišući njegovu važnu ulogu u starenju.[7] Ljudski Nol12 je također potreban za sazrijevanje ribosoma i integritet genoma.[8]

Porodica Nol12

uredi

Ljudski Nol12 pripada porodici proteina poznatih kao ribosomski vezujući proteini RBP-i. Ljudski članovi imaju ekvivalente u različitim vrstama. Njegov homolog u Drosophila melanogaster zove se Viriato, koji je uključen u razvoj očiju i nervnog sistema i bez njega, kod Drosophila melanogaster ne uspijeva razvoj oka. Gubitak "Viriato" također rezultirao je proliferacijom ćelija, kašnjenjem u razvoju i apoptozama.[9][10] hNOL12 homologue in rats is known as Nop25 and is responsible for nucleolar structure and integrity.[11] Njegov homolog kod kvasca nazvan je Rrp17, za koji je pokazano da ima 5′-3′ egzonukleaznu aktivnost i da je uključen u biogenezu ribosoma.[12]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000273899 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033099 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (December 2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
  6. ^ a b "Entrez Gene: NOL12 nucleolar protein 12".
  7. ^ Pinho M, Macedo JC, Logarinho E, Pereira PS (June 2019). "NOL12 Repression Induces Nucleolar Stress-Driven Cellular Senescence and Is Associated with Normative Aging". Molecular and Cellular Biology. 39 (12). doi:10.1128/MCB.00099-19. PMC 6549468. PMID 30988155.
  8. ^ Scott DD, Trahan C, Zindy PJ, Aguilar LC, Delubac MY, Van Nostrand EL, et al. (December 2017). "Nol12 is a multifunctional RNA binding protein at the nexus of RNA and DNA metabolism". Nucleic Acids Research. 45 (21): 12509–12528. doi:10.1093/nar/gkx963. PMC 5716212. PMID 29069457.
  9. ^ Marinho J, Martins T, Neto M, Casares F, Pereira PS (May 2013). "The nucleolar protein Viriato/Nol12 is required for the growth and differentiation progression activities of the Dpp pathway during Drosophila eye development". Developmental Biology. 377 (1): 154–65. doi:10.1016/j.ydbio.2013.02.003. PMID 23416177.
  10. ^ Marinho J, Casares F, Pereira PS (January 2011). "The Drosophila Nol12 homologue viriato is a dMyc target that regulates nucleolar architecture and is required for dMyc-stimulated cell growth". Development. 138 (2): 349–57. doi:10.1242/dev.054411. PMID 21177347. S2CID 18287789.
  11. ^ Suzuki S, Fujiwara T, Kanno M (July 2007). "Nucleolar protein Nop25 is involved in nucleolar architecture". Biochemical and Biophysical Research Communications. 358 (4): 1114–9. doi:10.1016/j.bbrc.2007.05.069. PMID 17524363.
  12. ^ Oeffinger M, Zenklusen D, Ferguson A, Wei KE, El Hage A, Tollervey D, et al. (December 2009). "Rrp17p is a eukaryotic exonuclease required for 5' end processing of Pre-60S ribosomal RNA". Molecular Cell. 36 (5): 768–81. doi:10.1016/j.molcel.2009.11.011. PMC 2806520. PMID 20005841.

Dopunska literatura

uredi